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子科生物報(bào)道:3月5日,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Protein & Cell 以封面論文的形式發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)李勁松研究組的研究成果“ Epigenetic integrity of paternal imprints enhances the developmental potential of androgenetic haploid embryonic stem cells ”。這項(xiàng)工作首次實(shí)現(xiàn)小鼠孤雄單倍體胚胎干細(xì)胞在體外培養(yǎng)過(guò)程中穩(wěn)定維持父源印記的表觀完整性,并進(jìn)一步提升了該細(xì)胞支持半克隆胚胎發(fā)育的潛能。
2008年,Austin Smith團(tuán)隊(duì)建立了添加Mek1/2抑制劑和Gsk3β抑制劑(2i)的胚胎干細(xì)胞(ESCs)培養(yǎng)環(huán)境,這種培養(yǎng)基可以使體外培養(yǎng)的小鼠胚胎干細(xì)胞獲得較好的多能性(pluripotency),極大的推動(dòng)了小鼠胚胎干細(xì)胞研究進(jìn)程。而然,隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,對(duì)于2i培養(yǎng)環(huán)境的細(xì)胞進(jìn)行甲基化測(cè)序后發(fā)現(xiàn),由于對(duì)Mek1/2信號(hào)通路的抑制,這種細(xì)胞中的DNA甲基化模式受到了明顯的抑制,其中也包括印記調(diào)控區(qū)域的甲基化模式,進(jìn)而嚴(yán)重降低了細(xì)胞的發(fā)育潛能。
2012年,李勁松研究組利用2i培養(yǎng)體系建立了孤雄單倍體胚胎干細(xì)胞(又稱為類精子干細(xì)胞),該細(xì)胞可以替代精子支持小鼠胚胎的發(fā)育產(chǎn)生半克隆小鼠。但在2i培養(yǎng)環(huán)境中,類精子干細(xì)胞的印記調(diào)控區(qū)域DNA甲基化會(huì)在培養(yǎng)過(guò)程中逐漸丟失,嚴(yán)重降低了半克隆小鼠的發(fā)育潛能(2%的半克隆胚胎發(fā)育成健康個(gè)體),極大的限制了這項(xiàng)技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。2015年,通過(guò)在類精子干細(xì)胞中敲除兩個(gè)父源印記調(diào)控區(qū)域(H19-DMR和IG-DMR)來(lái)模擬其甲基化,極大的提高了半克隆小鼠的發(fā)育潛能(20%的出生率),但是這種遺傳敲除的策略會(huì)給其后的應(yīng)用帶來(lái)不確定因素。
為了解決上述問(wèn)題,研究人員嘗試對(duì)于類精子干細(xì)胞的建系和培養(yǎng)過(guò)程進(jìn)行優(yōu)化,試圖在體外培養(yǎng)過(guò)程中實(shí)現(xiàn)父源印記表觀修飾的穩(wěn)定維持。為此,研究人員對(duì)比分析了三種常用的小鼠胚胎干細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境(S/L,2i/L和a2i/L)的優(yōu)缺點(diǎn),并選擇a2i/L培養(yǎng)環(huán)境進(jìn)行進(jìn)一步的改造和優(yōu)化,最終建立了基于a2i/L培養(yǎng)環(huán)境的兩步建系的策略(TSa2i)。該策略建立的類精子干細(xì)胞在接近60代的培養(yǎng)過(guò)程中可以穩(wěn)定維持父源印記表觀修飾的完整性,同時(shí)大幅提高了健康半克隆小鼠的出生效率(最高可以達(dá)到30%)。
此外,研究人員還發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)到后期代數(shù)的類精子干細(xì)胞印記甲基化水平進(jìn)一步升高,并伴隨體內(nèi)發(fā)育能力的增強(qiáng)。究其原因,研究人員發(fā)現(xiàn)TSa2i的類精子干細(xì)胞H19-DMR的甲基化水平表現(xiàn)出異質(zhì)性,大部分細(xì)胞維持高甲基化而少量細(xì)胞會(huì)逐漸丟失甲基化。有意思的是,H19-DMR甲基化水平高的細(xì)胞較低甲基化水平的細(xì)胞有增殖的優(yōu)勢(shì),從而使這些細(xì)胞在整體中數(shù)量增多,導(dǎo)致類精子干細(xì)胞能穩(wěn)定維持印記甲基化并出現(xiàn)后期代數(shù)細(xì)胞甲基化水平升高的現(xiàn)象。
基因組印記對(duì)于胚胎干細(xì)胞體內(nèi)發(fā)育能力起決定性作用,這項(xiàng)工作首次建立了能長(zhǎng)期穩(wěn)定維持雄性印記的類精子干細(xì)胞,并提升其發(fā)育潛能,為體內(nèi)遺傳篩選提供強(qiáng)大的工具,該研究也為建立穩(wěn)定維持印記的孤雌單倍體胚胎干細(xì)胞提供了新的思路。
分子細(xì)胞卓越中心博士生張紅玲,博士后李元元和博士生馬永健為本文共同第一作者。李勁松研究員為本文的通訊作者。該研究得到分子細(xì)胞卓越中心GTP研發(fā)中心,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)技術(shù)平臺(tái)和細(xì)胞分析技術(shù)平臺(tái)的大力支持。該工作得到中國(guó)科學(xué)院、基金委、科技部、上海市科委等經(jīng)費(fèi)支持。
模式圖:父源印記的表觀遺傳完整性增強(qiáng)了AG-haESCs的發(fā)育潛能
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