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子科生物報(bào)道:自今年2月新冠疫情暴發(fā)以來,北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心(BIOPIC)、北京未來基因診斷高精尖創(chuàng)新中心(ICG)研究員們在主任謝曉亮院士的帶領(lǐng)下積極投入抗疫工作,發(fā)揮在單細(xì)胞基因組測序和高精確度檢測等方面的特長、用最新的技術(shù)努力尋找治療手段、改進(jìn)診斷方法,在國家科技部和北京市教委的大力支持及北京市科委的協(xié)調(diào)下,聯(lián)合多家單位為抗擊新冠病毒貢獻(xiàn)力量,歷時3個月,成功從新冠肺炎康復(fù)期患者血漿中篩選出多個高活性中和抗體,研究成果發(fā)表于《細(xì)胞》雜志(“Cao Y etal., “Potent Neutralizing Antibodies against SARS-CoV-2 Identified by High-ThroughputSingle-Cell Sequencing of Convalescent Patients' B Cells,” Cell, DOI:10.1016/j.cell.2020.05.025.”)。 其中編號為BD-368-2的抗體表現(xiàn)突出,在假病毒實(shí)驗(yàn)中的半抑制濃度(IC50)達(dá)到1.2 ng/mL(8pM);在真病毒實(shí)驗(yàn)中IC50達(dá)到15 ng/mL (100pM)。在中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動物研究所(中國醫(yī)科院動研所)秦川教授團(tuán)隊(duì)的hACE2轉(zhuǎn)基因小鼠模型中,BD-368-2可完全抑制病毒感染,世界第一個完成了新冠抗體的動物模型評價。
此外,本工作還發(fā)現(xiàn)由VH3-53和VH3-66重鏈基因片段編碼的中和抗體在不同病人中高度富集,體現(xiàn)了一種在人群中針對新冠病毒 “反復(fù)出現(xiàn)的”抗體響應(yīng)(recurrent antibody response)。文章發(fā)表后,取得科研界廣泛認(rèn)可。
為了進(jìn)一步探尋了這些高活性中和抗體的分子機(jī)制,北大結(jié)構(gòu)生物學(xué)團(tuán)隊(duì)、抗體研發(fā)團(tuán)隊(duì)與中國醫(yī)科院動研所再度合作,于2020年9月15日在《細(xì)胞》雜志發(fā)表了新冠中和抗體機(jī)理研究最新進(jìn)展:Structurally resolved SARS-CoV-2 antibody shows high efficacy in severely infected hamsters and provides a potent cocktail pairing strategy。
結(jié)構(gòu)生物學(xué)蘇曉東課題組、肖俊宇課題組等合作研究了BD-368-2與新冠病毒Spike三聚體的相互作用機(jī)制,并成功解析了二者形成復(fù)合體的高分辨冷凍電鏡結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明,由于獨(dú)特的結(jié)合表位,BD-368-2與Spike受體結(jié)合區(qū)域(receptor binding domain, RBD)的結(jié)合不受其空間位置影響。無論RBD處于“上”或“下”的狀態(tài),BD-368-2均可與其發(fā)生很好的相互作用,從而徹底阻斷Spike三聚體與ACE2受體的結(jié)合。
之后,通過與中國醫(yī)科院動研所秦川課題組合作,證明BD-368-2不僅在顯現(xiàn)輕癥的hACE2轉(zhuǎn)基因小鼠模型中可以抑制新冠病毒,還可以在表現(xiàn)新冠重癥的成年倉鼠動物模型中顯著緩解肺炎癥狀(圖二、圖三)?;趥}鼠模型,秦川課題組研究了抗體不同給藥窗口、不同劑量的治療效果,建立了給藥時間、給藥劑量與治療效果的關(guān)系,為BD-368-2的臨床研究打下基礎(chǔ)。
最后,謝曉亮課題組、蘇曉東課題組、肖俊宇課題組等合作發(fā)現(xiàn)BD-368-2可以與VH3-53/VH3-66系列抗體同時結(jié)合RBD,并解析了多對此類抗體與RBD形成的三元復(fù)合體的晶體結(jié)構(gòu)(圖四)。在與中國食品藥品檢定研究院王佑春、黃維金課題組合作進(jìn)行的研究顯示,BD-368-2與BD-629(一個VH3-53/VH3-66系列中的高活性中和抗體)形成的抗體組合可以有效地中和自然界中已經(jīng)出現(xiàn)的、可以逃逸單一抗體治療的新冠病毒突變體。
這些研究為進(jìn)一步理解BD-368-2的活性機(jī)制、臨床應(yīng)用以及針對產(chǎn)生“突變逃逸”的新冠病毒變種的治療奠定了重要基礎(chǔ)。
北京大學(xué)杜碩、曹云龍、朱秦毓,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動物研究所于品、戚菲菲為共同第一作者。謝曉亮、蘇曉東、肖俊宇、秦川為共同通訊作者。該工作受到北京市政府教委、科委和國家教育部、科技部等部門的大力支持。
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