子科生物報(bào)道：有些兒童患有至少一種慢性病，依賴呼吸機(jī)等工具，需要多名?？漆t(yī)生的照顧和大量醫(yī)療保健資源，這些患兒被稱為醫(yī)療上復(fù)雜的兒童（Children with medical complexity，CMC）。大多數(shù)患兒都被懷疑有遺傳原因，但無法通過常規(guī)的基因檢測發(fā)現(xiàn)。

近日，多倫多病童醫(yī)院Robin Hayeems領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)開展了一項(xiàng)隊(duì)列研究，以確定基因組測序作為CMC診斷檢測的分析和臨床有效性。他們發(fā)現(xiàn)，近三分之一的患兒可通過基因組測序獲得診斷結(jié)果。這項(xiàng)成果發(fā)表在《JAMA Network Open》上。

Hayeems和她的同事在論文中寫道：“這項(xiàng)研究表明，基因組測序具有很高的分析和臨床有效性，能夠?yàn)榛純簬硇碌脑\斷結(jié)果。”她們認(rèn)為，基因組測序有望成為CMC的一線遺傳檢測。

在這項(xiàng)研究中，研究人員對49個家庭中的138人進(jìn)行基因組測序，其中包括40個trio家系。由于患兒平均接受過四個常規(guī)的遺傳檢測，因此他們的一些遺傳變異是已知的，大多數(shù)是良性或不明意義的變異。測序分析確定了全部124個此類變異，這表明基因組測序具有很高的分析有效性。

對于49名先證者，也就是家族中最先發(fā)現(xiàn)患有特定疾病的個體，15名在基因組測序后獲得了新的分子遺傳學(xué)診斷結(jié)果，診斷率達(dá)到30.6%。

例如，一名患兒X染色體上的KDM6A基因發(fā)生了單外顯子重復(fù)，導(dǎo)致Kabuki綜合征的發(fā)生。這個突變是母系遺傳的，但之前通過染色體芯片分析、外顯子組測序或MLPA（多重連接依賴式探針擴(kuò)增）技術(shù)都沒有檢測到。

三名兒童患有新的遺傳病，包括與RAC3相關(guān)的疾病以及兩種新的常染色體顯性神經(jīng)發(fā)育綜合征。另外九名兒童患有超罕見的遺傳病，或具有一種或多種非典型特征的極罕見遺傳病。

對于其中的五項(xiàng)診斷結(jié)果，目前都有相關(guān)的管理建議或干預(yù)措施，而一名患有癲癇性腦病的兒童已開始接受靶向治療。此外，四項(xiàng)診斷結(jié)果具有生殖咨詢意義，因?yàn)橥值艿膹?fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)至少為25%。其他疾病則是由新發(fā)突變引起，且復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)低。

研究人員指出，盡管這項(xiàng)單中心的研究存在著一些限制，但他們的結(jié)果支持將基因組測序作為醫(yī)療上復(fù)雜兒童的一線遺傳檢測?！盎蚪M測序有望增加確診CMC的比例，”她們寫道。

同時，她們在論文中補(bǔ)充說，RNA-seq和全基因組甲基化分析等組學(xué)工具有望進(jìn)一步提高這些患者的診斷率。

原文檢索

Genome Sequencing as a Diagnostic Test in Children With Unexplained Medical Complexity

JAMA Netw Open. 2020;3(9):e2018109. doi:10.1001/jamanetworkopen.2020.18109