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PNAS:Agos蛋白指導(dǎo)導(dǎo)向DNA鏈切割靶標(biāo)DNA鏈的新機制


深圳子科生物報道:2018年12月27日,《Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America,PNAS》雜志在線發(fā)表題為“Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated DNA target cleavage”的論文。該論文在原子水平闡明了細菌的Agos蛋白中參與切割活性的兩個對稱的精氨酸的重要意義。

RNA干擾對基因的表達調(diào)控具有重要作用,并且在生物中普遍存在。Ago蛋白結(jié)合小RNA是RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體的核心組分,它們利用小的RNA引導(dǎo)鏈靶向互補配對的RNA分子,降解目的mRNA或者抑制目的mRNA的翻譯。與真核Ago蛋白利用RNA引導(dǎo)鏈靶向RNA分子不同,大量研究表明原核Ago蛋白利用DNA引導(dǎo)鏈靶向DNA分子,具有DNA介導(dǎo)的DNA干擾作用。TtAgo 是通過RNase H型機制剪切靶標(biāo)DNA或者RNA,Ago構(gòu)象的改變促進活性中心在非活性狀態(tài)和活性狀態(tài)之間轉(zhuǎn)換,但是Ago具體催化機制還不清楚。

在這項研究中,王艷麗課題組及其合作者發(fā)現(xiàn)在TtAgo中的兩個帶正電荷的氨基酸具有重要作用。在TtAgo中R545在切割靶鏈時是穩(wěn)定指構(gòu)象的主要的氨基酸殘基而R486的作用比較微弱,這就表明在不同種生物的Ago蛋白切割靶鏈時谷氨酸指兩邊的氨基酸殘基的分子機制有所變化。

這項研究為中國科學(xué)院生物物理研究所王艷麗課題組與香港科技大學(xué)Xuhui Huang實驗室以及紐約大學(xué)Yingkai Zhang實驗室合作完成。其中,中國科學(xué)院生物物理研究所王艷麗研究員、香港科技大學(xué)Xuhui Huang教授、紐約大學(xué)Yingkai Zhang教授是本文的共同通信作者。該研究得到科技部、國家自然科學(xué)基金以及中國科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(B類)的資助,上海同步輻射光源(SSRF)以及日本同步輻射光源SPring-8為該研究提供了重要的技術(shù)支持。

原文標(biāo)題:

Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated DNA target cleavage
 

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