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深圳子科生物報(bào)道:RNA分子有許多關(guān)鍵作用:信使RNA(mRNA)幫助儲(chǔ)存在DNA中的遺傳信息翻譯成蛋白質(zhì),人類細(xì)胞中mRNA約占RNA總數(shù)的5%;其他RNA分子不會(huì)被翻譯成蛋白質(zhì),很多必須與蛋白質(zhì)相互作用,不同類型的RNA與特定蛋白質(zhì)形成高度復(fù)雜的分子機(jī)器,比如核糖體。
“RNA和蛋白質(zhì)相互作用形成一個(gè)巨大的網(wǎng)絡(luò),但我們對(duì)這個(gè)網(wǎng)絡(luò)的確切組成還知之甚少,我們想要了解哪些蛋白質(zhì)與RNA結(jié)合,不同細(xì)胞類型或應(yīng)激條件,這個(gè)網(wǎng)絡(luò)的表現(xiàn)有何不同,現(xiàn)在,我們已經(jīng)有了一種方法,使我們能夠首次研究這些問(wèn)題,”DKFZ的Jeroen Krijgsveld說(shuō)。
目前為止,針對(duì)蛋白質(zhì)RNA相互作用的方法只能分析mRNAs,其他非編碼RNA(包括近兩年新發(fā)現(xiàn)的很多品種)與蛋白質(zhì)的相互作用無(wú)法利用現(xiàn)有方法檢測(cè)。然而,非編碼RNAs的數(shù)量遠(yuǎn)超mRNAs,它們的用途也相當(dāng)廣泛。
這種分析所有類型RNA與細(xì)胞蛋白質(zhì)相互作用的新工具名為XRNAX,利用它,科學(xué)家鑒定了數(shù)百種以前不知道的RNA結(jié)合蛋白,而且不僅能看到什么蛋白與RNA結(jié)合,還能看到它們的結(jié)合程度。文章還描述了當(dāng)細(xì)胞暴露于毒素時(shí)的RNA結(jié)合變化。
“利用XRNAX,我們能夠測(cè)量蛋白質(zhì)與RNA之間的所有相互作用,這是以前沒(méi)人能夠測(cè)量的,”新方法的研發(fā)者Jakob Trendel說(shuō)。“蛋白質(zhì)-RNA相互作用疑似與多種疾病有關(guān),包括癌癥、肌萎縮性側(cè)索硬化癥以及HIV等病毒感染?,F(xiàn)在我們有方法好好觀察它們了?!?
原文檢索:The Human RNA-Binding Proteome and Its Dynamics during Translational Arrest
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