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Microbiome:中國嚙齒類動物攜帶病毒組的特征



深圳子科生物報(bào)道:

新發(fā)傳染病往往對人類健康、社會穩(wěn)定和經(jīng)濟(jì)發(fā)展帶來巨大沖擊,因此其防控一直受到政府和社會的高度重視。據(jù)統(tǒng)計(jì),引起全球各地病毒性新發(fā)傳染病疫情的病原體70%以上來自野生動物源性病毒的跨種感染。然而由于以往我們對野生動物病毒的背景及特征缺乏系統(tǒng)性的研究,當(dāng)面對新發(fā)傳染病暴發(fā)時(shí),嚴(yán)重制約了病因的診斷、溯源、防治以及采取有效的防控措施。因此,闡明與人類新發(fā)傳染病關(guān)聯(lián)性密切的野生動物病毒組特征,并以此為基礎(chǔ)建立新發(fā)傳染病監(jiān)測、預(yù)警、診治和溯源等防控體系,實(shí)現(xiàn)新發(fā)傳染病防控由被動應(yīng)對轉(zhuǎn)向主動防控已成為全球傳染病防控和科學(xué)工作者的共識。2017年底《科學(xué)》雜志發(fā)表文章全面闡述了開展全球野生動物病毒組研究的意義。

來自中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所衛(wèi)生部病原系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室金奇研究員團(tuán)隊(duì)在我國嚙齒類動物呼吸道/消化道病毒組特征研究方面取得新進(jìn)展,相關(guān)研究成果近日在Microbiome雜志發(fā)表,題為 “Comparative analysis of rodent and small mammal viromes to better understand the  wildlife origin of emerging infectious diseases”。

翼手目動物(蝙蝠)和嚙齒目動物(鼠類)數(shù)量多、分布廣,是引發(fā)動物源性人類新發(fā)傳染病的兩大類最主要的哺乳類野生動物。

金奇研究團(tuán)隊(duì)繼2016年在《ISME Journal》等雜志發(fā)表系列文章揭示了全國范圍內(nèi)代表性蝙蝠呼吸道/消化道病毒組特征后,接續(xù)開展了中國境內(nèi)嚙齒目動物攜帶病毒組特征的研究工作,通過對覆蓋中國20個(gè)省市自治區(qū)和直轄市55個(gè)種共計(jì)3055只嚙齒動物等小動物樣本的病毒組篩查分析,利用得到的65.6GB的測序數(shù)據(jù)分析并經(jīng)過驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)了這些小型哺乳動物病毒涉及70個(gè)病毒科(包含23個(gè)哺乳動物病毒科),鑒定獲得了超過600個(gè)新的型/亞型病毒,可分類為203個(gè)新的病毒種。其中一些重要病毒如漢坦病毒、砂粒病毒、冠狀病毒和動脈炎病毒等基因組結(jié)構(gòu)、分布地域和宿主等特征。

這一研究為國際上首次大范圍、多鼠種的病毒組研究,該類數(shù)據(jù)和特征體系的構(gòu)建不僅有助于全面了解動物病毒生態(tài)的多樣性,而且為構(gòu)建動物源性傳染病預(yù)警、溯源診治體系提供了重要基礎(chǔ),為提升我國新發(fā)突發(fā)傳染病防控能力提供了技術(shù)支撐。此外,該項(xiàng)工作也為院校突發(fā)疫情和重大醫(yī)療任務(wù)等科技支撐能力建設(shè)等提供了保障。  

原文標(biāo)題:

Comparative analysis of rodent and small mammal viromes to better understand the  wildlife origin of emerging infectious diseases

https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-018-0554-9  

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