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深圳子科生物報(bào)道:
人類(lèi)誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)具有公認(rèn)且廣泛的治療前景,但是有關(guān)它的“突變載量”仍尚未完全表征。
全球范圍已有超過(guò)1000種iPSCs細(xì)胞系被建立。iPSCs來(lái)自體細(xì)胞重編程,像皮膚細(xì)胞這種,很可能由于常年暴露于陽(yáng)光和紫外線(xiàn)輻射而積累許多非遺傳性的體細(xì)胞突變(somatic mutations)。雖然,之前有研究部分表征過(guò)iPSCs細(xì)胞中的體細(xì)胞突變,但是我們對(duì)這些突變的確切載量還不確定。
“為了真正有效利用iPSCs,我們需要在個(gè)體基礎(chǔ)上檢測(cè)到每株iPSCs的體細(xì)胞突變,方可以對(duì)特定人類(lèi)疾病和/或移植療法模型進(jìn)行優(yōu)劣排序,”加州大學(xué)圣地亞哥分?;蚪M醫(yī)學(xué)研究所主任、文章一作Kelly A. Frazer博士說(shuō)。
本周他們?cè)凇禖ell Reports》雜志發(fā)表了一篇文章,研究人員使用全基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組和表觀遺傳組數(shù)據(jù)對(duì)來(lái)自iPSCORE資源和WiCell的18株iPSCs(皆為非盈利性干細(xì)胞系)的全基因組序列進(jìn)行了詳細(xì)盤(pán)查。
除了擴(kuò)大范圍描述來(lái)自親本細(xì)胞的克隆突變和拷貝數(shù)改變(染色體重復(fù)或缺失),研究者還表征了另外兩種新突變類(lèi)型:親本細(xì)胞中因紫外線(xiàn)引起的突變,以及親本細(xì)胞中原本不存在,但是在iPSCs重編程亞克隆中出現(xiàn)的突變。
研究人員發(fā)現(xiàn),雖然絕大多數(shù)突變位于關(guān)閉染色質(zhì)相關(guān)的表觀遺傳區(qū),然而,在iPSCs重編程過(guò)程中,亞克隆突變與活性染色質(zhì)以及基因表達(dá)改變關(guān)聯(lián)也比較大。
原文檢索:Insights into the Mutational Burden of Human Induced Pluripotent Stem Cells from an Integrative Multi-Omics Approach
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