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中科院學(xué)者Genome Medicine報(bào)道肝細(xì)胞癌特異的診斷標(biāo)志物


深圳子科生物報(bào)道:

全球每年肝癌新發(fā)病例約75萬(wàn)人、死亡約70萬(wàn)人。肝細(xì)胞癌是肝癌的主要類(lèi)型、約占肝癌的80%以上,全球每年半數(shù)以上的新發(fā)和死亡病例發(fā)生在中國(guó),是危害我國(guó)人民生命健康的重大疾病。由于診斷方法的局限性,大多數(shù)肝細(xì)胞癌患者就診時(shí)已屬中晚期,失去了最佳治療時(shí)機(jī)。因此,發(fā)現(xiàn)新的肝細(xì)胞癌診斷標(biāo)志物特別是血清診斷標(biāo)志物,及時(shí)有效的早查、早診、早發(fā)現(xiàn),是提高患者生存率、降低死亡率的關(guān)鍵之一。

中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院營(yíng)養(yǎng)與健康研究院的研究人員發(fā)表了題為“Integrative analysis of DNA methylation and gene expression reveals hepatocellular carcinoma-specific diagnostic biomarkers”的最新研究成果。該研究系統(tǒng)研究了肝癌相比其它腫瘤的特異性標(biāo)志物,為未來(lái)肝癌早診提供了一種新的解決方案。

這一研究成果公布在Genome Medicine雜志上,由營(yíng)養(yǎng)與健康院李亦學(xué)研究組完成。

以往研究表面癌癥發(fā)生早期和進(jìn)展過(guò)程中,都存在DNA甲基化的變化。通過(guò)檢測(cè)血液中DNA甲基化水平的變化,可能發(fā)現(xiàn)早期的癌癥。目前臨床常規(guī)診斷和篩查中廣泛使用的腫瘤血清標(biāo)志物基本為血清蛋白標(biāo)志物。

李亦學(xué)研究員組的李虹、程錦明等通過(guò)比較375個(gè)肝癌組織、50個(gè)正常肝組織、184個(gè)健康人血液、以及3780個(gè)其它癌癥患者的甲基化圖譜,篩選出了肝癌中特異高甲基化的位點(diǎn)。

他們基于這些位點(diǎn)使用Logistic回歸建立了肝癌預(yù)測(cè)模型,對(duì)三套獨(dú)立數(shù)據(jù)集(327個(gè)HCC和122個(gè)正常樣本)和10個(gè)臨床病人樣本進(jìn)行評(píng)估。結(jié)果表明肝癌預(yù)測(cè)模型對(duì)肝癌的預(yù)測(cè)靈敏度達(dá)到92%,并能排除98%的正常肝組織和其它類(lèi)型的癌癥。

與已發(fā)表的肝癌甲基化標(biāo)志物相比,這些新找到的標(biāo)志物是唯一可以將HCC與其它癌癥區(qū)分開(kāi)的?;谠擁?xiàng)發(fā)現(xiàn)的后續(xù)研究已經(jīng)展開(kāi)。

原文標(biāo)題:

Integrative analysis of DNA methylation and gene expression reveals hepatocellular carcinoma-specific diagnostic biomarkers
 

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