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分離人體腸道微生物群免疫刺激成員的新技術:IgA-seq


?子科生物報道:UMC烏得勒支大學的科學家們開發(fā)了一種新技術,可以有效地從糞便樣本中分離出一種特定的腸道細菌亞群,這些細菌可以被IgA抗體識別。這些“IgA-coated”的細菌與一系列疾病有關,這項提出的新技術有可能揭示這些相關性背后的機制,并最終導致新的治療策略。

眾所周知,腸道微生物群,即生活在我們腸道內的微生物群落,在教導我們的免疫系統(tǒng)何時以及如何應對外部威脅方面發(fā)揮著至關重要的作用。因此,它是調節(jié)我們的身體對某些疾病的反應的關鍵。負責免疫細胞和微生物之間相互作用的關鍵分子之一是抗體。我們腸道中最豐富的抗體類型是免疫球蛋白A (IgA),一旦釋放,就會識別并結合特定的腸道細菌。在健康個體中,平均約有35%的腸道細菌被IgA覆蓋。

IgA-coated細菌的作用

然而,在患有腸道炎癥的患者中,IgA-coated細菌的比例增加,并且在過敏、哮喘、腸易激綜合征、多發(fā)性硬化癥和炎癥性腸?。↖BD)等疾病中也觀察到這一細菌亞群組成的改變。雖然這些微生物與上述疾病之間存在聯(lián)系,但IgA-coated細菌在健康和疾病中的確切生物學作用及其潛在機制仍有待研究。這些信息對于制定防治這些疾病的戰(zhàn)略至關重要。然而,目前用于研究IgA-coated細菌的方法是次優(yōu)的,因為它們速度慢,效率低,而且昂貴。

捕獲IgA-coated細菌

由于這些原因,UMC烏得勒支分校的微生物學家Marcel de Zoete博士和胃腸病學教授Bas Oldenburg博士的研究小組著手開發(fā)一種技術,可以更快、更高效地從人類糞便樣本中分離出IgA-coated的細菌。研究小組提出了一個有吸引力的解決方案:從糞便樣本開始,他們通過將微小的磁珠結合到抗體本身來瞄準與細菌相連的IgA抗體。這樣,當細菌與磁鐵接觸時,iga涂層的細菌被捕獲,而所有其他細菌都很容易被沖走。

雖然這種方法可以更有效、高通量地鑒定和分離IgA-coated細菌,但與其他經典技術相比,這種新技術的效果如何?在一組廣泛的對照實驗中,博士后研究員Merel Van Gogh博士(醫(yī)學微生物學系)和博士候選人Jonas Louwers醫(yī)學博士(胃腸病學和轉化免疫學中心)能夠證明,這種被稱為下一代IgA-SEQ的新設置與以前的方法相比,保留了定性相似的結果。同時提供了一系列的優(yōu)勢,如快速分析大量樣品的能力,以及對細菌DNA進行高質量的測序。

有價值的增加

首席研究員Marcel de Zoete總結道:“下一代IgA-SEQ是我們科學工具箱的一個有價值的補充,可以揭示IgA-coated細菌在健康和疾病中的作用。例如,我們現(xiàn)在可以識別與加重或緩解IBD癥狀相關的特異性免疫刺激菌株。實施這項技術將使科學家能夠更好地了解微生物群在腸道和全身性炎癥疾病中的作用,并可能為未來的治療開辟新的途徑?!?/p>

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