子科生物報(bào)道：新開(kāi)發(fā)的一種名為 ReapTEC 的方法發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個(gè)活躍的雙向增強(qiáng)子。對(duì) GWAS 數(shù)據(jù)的進(jìn)一步分析表明，各種免疫介導(dǎo)疾病，如多發(fā)性硬化癥和風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎，都與這些增強(qiáng)子中的遺傳變異有關(guān)。

由日本理研綜合醫(yī)學(xué)科學(xué)中心(IMS)、京都大學(xué)和意大利IFOM ETS的Yasuhiro Murakawa領(lǐng)導(dǎo)的研究人員發(fā)現(xiàn)了幾種罕見(jiàn)類型的輔助性T細(xì)胞，它們與多發(fā)性硬化癥、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎甚至哮喘等免疫疾病有關(guān)。

這一發(fā)現(xiàn)發(fā)表在7月4日的《科學(xué)》雜志上，他們通過(guò)一項(xiàng)名為ReapTEC的新技術(shù)使這一發(fā)現(xiàn)成為可能，該技術(shù)能在罕見(jiàn)的T細(xì)胞亞型中發(fā)現(xiàn)與特定免疫疾病相關(guān)的基因增強(qiáng)子。新的T細(xì)胞圖譜已經(jīng)公開(kāi)，將有助于開(kāi)發(fā)治療免疫介導(dǎo)疾病的新藥物。

輔助性T細(xì)胞是一種白細(xì)胞，構(gòu)成了免疫系統(tǒng)的很大一部分。它們識(shí)別病原體并調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)。許多免疫介導(dǎo)性疾病是由T細(xì)胞功能異常引起的。在多發(fā)性硬化癥等自身免疫性疾病中，它們會(huì)錯(cuò)誤地攻擊身體的某些部位，就好像它們是病原體一樣。在過(guò)敏的情況下，T細(xì)胞對(duì)環(huán)境中的無(wú)害物質(zhì)(如花粉)反應(yīng)過(guò)度。我們知道幾種常見(jiàn)的T細(xì)胞，但最近的研究表明，存在罕見(jiàn)和特殊類型的T細(xì)胞，它們可能與免疫介導(dǎo)的疾病有關(guān)。

在包括T細(xì)胞在內(nèi)的所有細(xì)胞中，都有稱為“增強(qiáng)子”的DNA區(qū)域。這種DNA不編碼蛋白質(zhì)。相反，它為小片段RNA編碼，并增強(qiáng)其他基因的表達(dá)。因此，T細(xì)胞增強(qiáng)子DNA的變異會(huì)導(dǎo)致基因表達(dá)的差異，從而影響T細(xì)胞的功能。一些增強(qiáng)子是雙向的，這意味著DNA的兩條鏈都被用作增強(qiáng)子RNA的模板。

來(lái)自RIKEN IMS幾個(gè)不同實(shí)驗(yàn)室的研究人員，以及其他研究所的同事，合作開(kāi)發(fā)了新的ReapTEC技術(shù)，并尋找雙向T細(xì)胞增強(qiáng)劑和免疫疾病之間的聯(lián)系。在分析了大約100萬(wàn)個(gè)人類T細(xì)胞后，他們發(fā)現(xiàn)了幾組罕見(jiàn)的T細(xì)胞類型，占總數(shù)的不到5%。將ReapTEC應(yīng)用于這些細(xì)胞，鑒定出近63,000個(gè)活性雙向增強(qiáng)子。

為了弄清楚這些增強(qiáng)子是否與免疫疾病有關(guān)，他們求助于全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)，該研究報(bào)告了許多與各種免疫疾病有關(guān)的基因變異，稱為單核苷酸多態(tài)性。當(dāng)研究人員將GWAS數(shù)據(jù)與他們的ReapTEC分析結(jié)果結(jié)合起來(lái)時(shí)，他們發(fā)現(xiàn)免疫介導(dǎo)疾病的遺傳變異通常位于他們鑒定的稀有T細(xì)胞的雙向增強(qiáng)子DNA中。相比之下，神經(jīng)系統(tǒng)疾病的遺傳變異沒(méi)有顯示出類似的模式，這意味著這些罕見(jiàn)T細(xì)胞中的雙向增強(qiáng)子與免疫介導(dǎo)的疾病特異性相關(guān)。

更深入地研究數(shù)據(jù)，研究人員能夠證明某些罕見(jiàn)T細(xì)胞中的個(gè)體增強(qiáng)子與特定的免疫疾病有關(guān)。

總體而言，在63,000個(gè)雙向增強(qiáng)子中，他們能夠確定606個(gè)包含與18種免疫介導(dǎo)疾病相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性。最后，研究人員能夠確定一些基因是這些疾病相關(guān)增強(qiáng)子的目標(biāo)。例如，當(dāng)他們激活含有與炎癥性腸病相關(guān)的遺傳變異的增強(qiáng)子時(shí)，產(chǎn)生的增強(qiáng)子RNA引發(fā)IL7R基因的上調(diào)。

“在短期內(nèi)，我們已經(jīng)開(kāi)發(fā)出一種新的基因組學(xué)方法，可以被世界各地的研究人員使用，通過(guò)這種方法，我們發(fā)現(xiàn)了新型輔助性T細(xì)胞以及與免疫疾病相關(guān)的基因。我們希望這些知識(shí)將有助于更好地理解人類免疫介導(dǎo)疾病的遺傳機(jī)制?！盡urakawa說(shuō)。

從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看，研究人員相信后續(xù)實(shí)驗(yàn)將能夠識(shí)別出可用于治療免疫介導(dǎo)疾病的新分子。