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子科生物報道:快速抗原檢測的可用性極大地推動了遏制COVID-19傳播的努力,但每一種新的擔憂都引發(fā)了診斷檢測是否仍然有效的問題。發(fā)表在《細胞》雜志上的一項新研究試圖解決這些問題,方法是評估在未來的SARS-CoV-2變種挑戰(zhàn)下,檢測的速度如何。
該研究團隊由埃默里大學領導,由美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)快速加速診斷(RADx)技術項目資助,開發(fā)了一種新的方法,用于評估新冠病毒的突變?nèi)绾斡绊懣焖倏乖瓩z測中使用的抗體的識別。因為大多數(shù)快速抗原檢測都是檢測SARS-CoV-2核衣殼蛋白(N蛋白),該團隊直接測量了N蛋白的突變?nèi)绾斡绊懺\斷抗體識別目標的能力。
埃默里大學生物化學系助理教授、第一篇研究報告的作者Filipp Frank博士說:“根據(jù)我們的發(fā)現(xiàn),令人擔憂的SARS-CoV-2的主要變體都不包含會影響當前快速抗原檢測抗體能力的突變。此外,這些數(shù)據(jù)使我們能夠提前一步,針對可能出現(xiàn)的幾乎任何變體預測測試性能?!?/p>
該研究使用了一種稱為深度突變掃描(Deep mutational scanning)的方法,在一個單一的高通量實驗中評估N蛋白中所有可能的突變。然后,研究人員測量了突變對它們與11種商用快速抗原檢測中使用的抗體相互作用的影響,并確定了可能導致抗體逃逸的突變。
埃默里大學生物化學系教授、資深研究作者Eric Ortlund博士說:“準確和有效地識別受感染者仍然是減緩COVID-19的一項至關重要的策略,我們的研究提供了關于未來可能干擾檢測的SARS-CoV-2突變的信息。這里概述的結(jié)果可以讓我們快速適應病毒的新變種繼續(xù)出現(xiàn),代表著立即的臨床和公共衛(wèi)生影響?!?/p>
研究結(jié)果表明,變異中N蛋白發(fā)生突變從而躲過診斷測試的情況相對罕見,但有一小部分序列可能會影響檢測。研究人員、公共衛(wèi)生官員和測試制造商可以使用這些數(shù)據(jù)來確定診斷測試是否需要評估其檢測這些突變的能力,或為未來的測試設計提供信息。
國家生物醫(yī)學成像和生物工程研究所(NIBIB)主任、NIH RADx?技術項目負責人Bruce J. Tromberg博士說:“考慮到新變體的無盡循環(huán),這項研究的數(shù)據(jù)在未來幾年將是有用的?!?br>
雖然許多擔憂的變體包含N蛋白的多重突變,但研究作者指出,他們的方法沒有評估多重突變?nèi)绾斡绊懺\斷抗體識別,這代表了該研究的局限性。
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